筑波大學,理化學研究所,科學技術振興機構(JST)

令和3年6月25日

筑波大學
理化學研究所
科學技術振興機構(JST)

生命科學実験の効率的な自動化を実現するスケジューリング手法を開発

生命科學実験をロボットなどの機器を用いて自動化し、人が行うよりも大幅に効率化したり、実験の再現性を向上させたりする試みが、世界的に始まっています。実験の自動化において、さまざまな種類の機器を連攜させ、複數の実験を並列に実行することができれば、さらなる効率化が可能です。このため、どの機器で、いつ、どの手順を実行するかを決定するためのスケジューリング手法が研究されてきました。しかし、生細胞や不安定な生體分子を扱う実験の中には、素早く行わなくてはならない手順があり、このような時間制約は、これまで十分に考慮されていませんでした。

本研究では、こういった時間制約のある実験手順を複數の機器で効率よく実行するためのスケジューリング問題に対して、混合整數計畫問題として數理的に定式化した上で、分枝限定法を用いて解を求める方法を開発しました。この方法では、シミュレーションにより、時間制約を満足させながら全體の実行時間が最小となるようなスケジュールを決定することが可能です。

さらに、あらかじめ決められた実験プロトコルや実験室の構成に基づいたスケジューリングだけでなく、シミュレーション結果を、実行時間を短縮する実験プロトコルや実験室の構成の設計にも利用できることを示しました。

本手法により、異種?多數のロボットに実験を効率よく実行させることが可能となり、ロボット実験施設の実現に向けた基盤技術となることが期待されます。

本研究成果は、日本時間2021年6月25日に「SLAS Technology」に掲載されます。

本研究は、科學技術振興機構(JST) 未來社會創造事業の探索加速型「共通基盤」領域(運営統括:長我部 信行)における研究開発課題「ロボティックバイオロジーによる生命科學の加速」(研究開発代表者:高橋 恒一)による研究プロジェクトの一環として実施されました。

<プレスリリース資料>

<論文タイトル>

“Optimal scheduling for laboratory automation of life science experiments with time constraints”
DOI:10.1177/24726303211021790

<お問い合わせ先>

(英文)“Staying on Schedule”

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